Alles begann mit einer seltsamen Erscheinung - einer grellen Lichtsäule mitten in der Nacht. Seitdem verschwinden Leute und es geschehen unerklärliche Selbstmorde und Morde. An allem scheint die Todesgöttin Boogiepop beteiligt zu sein und Nagi macht es zu ihrer Aufgabe, Boogiepop zu stellen und das Geheimnis um ihr Erscheinen in der Stadt zu ergründen. Boogiepop Phantom ist eine Reihe lose zusammenhängender Einzelgeschichten, in deren Verlauf der Zuschauer nach und nach, aber nicht unbedingt in der richtigen Reihenfolge, in das Geheimnis um Boogiepop eingeweiht wird. Die entscheidenden Hinweise zu finden und zu enträtseln stellt den Zuschauer vor eine spannende aber nicht gerade leichte Aufgabe, die diese Serie zu einer fesselnden und nervenaufreibenden Mystery-Serie macht.
Diese Serie besteht aus einminütigen Clips, gemacht von bekannten Leuten aus Japans Animationsindustrie. Der Titel der Sammlung, Ani*Kuri15, ist eine Abkürzung aus den Wörtern »Anime« und »Schöpfer«. In den kurzen Clips sind diverse Ideen und Themen auf unterschiedlichste Art und Weise aufgearbeitet und visualisiert worden.
Im Ginza-Viertel von Toyko befindet sich eine ruhige Bar namens Eden Hall, die nur wenige Menschen zu Gesicht bekommen. Sie wird von dem legendären Barkeeper Ryō Sasakura geführt – ein Genie, das den richtigen Drink für den richtigen Kunden mixt. Während seiner Zeit in Eden Hall kommen Kunden aus allen Gesellschaftsschichten und mit allen möglichen Problemen vorbei, um ein göttliches Getränk zu leeren und sich mit Ryu auszutauschen, der immer ein offenes Ohr für die Kunden hat. Oft hilft er ihnen, ihre Probleme zu lösen, damit sie ihr Leben wieder in den Griff bekommen.
Die Geschichte spielt in einem Sommer des 21. Jahrhunderts. Durch eine unbekannte Katastrophe sind in Tokios Shinjuku keine Menschen mehr. Das einzige, was zurückbleibt, sind die Donyatsuhybriden, eine Mischung aus Katze und Donut und die Bagaru, eine Mischung aus Katze und Bagel.