Dr. Light und Dr. Wily sind zwei geniale Wissenschaftler und arbeiten gemeinsam an neuer Robotertechnik. Eines Tages entwickeln sie einen sehr fortschrittlichen Prototyp. Doch kurz nach dessen Aktivierung beginnt dieser willkürlich das Labor zu zerstören. Dr. Light nimmt an, dass das Führungssystem des Prototyps, das Dr. Wily persönlich programmiert hat, Ursache des Problems ist und schlägt vor nochmal ganz von Vorne anzufangen. Dr. Wily sieht dies aber als Beleidiung seiner Genialität an und versucht in der darauffolgenden Nacht die Baupläne zu stehlen, wird aber von Dr. Light erwischt. Dennoch schafft es Dr. Wily ihn zu überwältigen und zusammen mit dem Prototyp zu entkommen. In seinem neuen Unterschlupf modifiziert er diesen dann zu Proto Man.
Die Mighty Ducks sind von ihrem Planeten Puck World, der durch einen Saurienoverlord namens Dragaunus zerstört wurde, auf die Erde gereist und müssen nun gegen den Overlord kämpfen, der auch die Erde erobern will. Phil Polmfeather, ein Mensch, wird ihr Manager, nachdem er gemerkt hat, dass die Enten sehr gut Eishockey spielen können. Doch Wildwing, Nosedive, Duke L’Orange, Mallory, Tanya und Grin haben nicht nur Dragaunus als Feind. Sie müssen nicht nur gegen andere Verbrecher kämpfen, sondern auch noch die Eishockeymeisterschaft gewinnen.
Nachdem Bon sich versehentlich in einen Fall der Zeit-Patrouille einmischt, muss er gemeinsam mit Agentin Ream unschuldige Menschenleben aus der Vergangenheit retten.