Im viktorianischen England erzählt die junge und schöne Alice die Geschichte eines seltsamen neuen Landes, das auf der anderen Seite eines Kaninchenbaus existiert. Ihre Ärzte halten Alice für verrückt und wollen sie alles vergessen lassen. Während Alice bereit ist, alles hinter sich zu lassen, weiß sie, dass diese Welt real ist. Pünktlich retten der Knave of Hearts und das White Rabbit sie vor einem zum Scheitern verurteilten Schicksal. Gemeinsam stürzt das Trio durch den Kaninchenbau ins Wunderland, wo nichts unmöglich ist.
Der legendäre Meeresforscher Jacques Cousteau nimmt fünf Jugendliche mit auf eine Reise in die Unterwasserwelt. Die Zeichentrickserie wurde inspiriert von den Entdeckungen Cousteaus, seinen ungewöhnlichen Abenteuern und der Faszination für die gewaltige Schönheit der noch immer unerforschten Meeresgründe.
Die Geschichte beginnt bei einem Geschichtenerzähler namens »Drosselmeyer«, welcher kurz vor der Vollendung seines letzten Buches verstarb. Seine Märchenfigur, ein Prinz, »stieg« aus dem Buch heraus und bekämpfte eine »Monsterkrähe«. Der Kampf ging eine lange Zeit, bis sich der Prinz entschloss, sein Herz zu opfern, um die Krähe endgültig wegzusperren. Dieses »Opfer« sorgte dafür, dass er all seine Gefühle und sein Gedächtnis verlor. Die Welt lag wieder im Frieden, doch seine Seele wurde »stumm«.
Wunderland hat sich mit dem falschen Mädchen angelegt! Judotrainerin Alice Hamilton hat wieder mal Stress mit ihrem Freund Jack. Und das aus gutem Grund: Als Alice zehn Jahre alt war, hat ihr Vater die Familie über Nacht verlassen. Dieses einschneidende Erlebnis hatte zur Folge, dass Alice seither zu keinem Mann mehr Vertrauen fassen kann – auch nicht zu Jack. Als dieser nun Alice einen Ring schenken möchte, überkommt sie Panik, und sie schickt ihn fort. Kurz darauf wird Jack wie aus heiterem Himmel von ein paar dunklen Gestalten entführt. Alice nimmt die Verfolgung auf – und landet, einem weißen Kaninchen durch einen Spiegel folgend, im Wunderland.